公元4世纪，罗马帝国日渐式微，在亚历山大港，多神教的智者希帕提娅（蕾切尔·薇姿 Rachel Weisz 饰）为学生们授课。奥利斯蒂斯（奥斯卡·伊撒克 Oscar Isaac 饰）对她一再示爱，甚至在剧院果敢剖明；奴隶达乌斯（麦克思·明格拉 Max Minghella 饰）也对她很有好感，但因身份低微没法启口。与此同时，基督教徒声张的自由，让达乌斯的信奉开端晃…